学校设基础医学院、第一临床学院、药学院、针灸推拿学院、护理学院、医药科技学院、成人教育学院、职业技术学院、经济管理系和信息工程系。有16个专业或专业方向，即中医学专业：七年制本硕连读中医班、本硕连读英语班、本硕连读信息工程班、本硕连读中西医结合班；本科六年制中医学英语班；五年制中医学班、中医学骨伤班、中医学美容班。中药学专业：本科五年制中药学英语班；四年制中药学班、中药制药班、中药经营管理班。针灸推拿学专业：本科六年制针灸推拿学日语班；五年制针灸推拿学班。本科五年制中西医临床医学专业和护理学专业。4个博士学位授权点：中医学基础、中医内科、中西医结合临床、生药学及17个硕士学位授权点。4个国家中医药管理局局级重点学科：中医基础理论、中药生药学、中医儿科学、中医外科肛肠学。三部（基础部、社会科学部、体育教研部）；科研机构设有一院六所一个中心（辽宁省中医研究院、基础医学研究所、中医基础研究所、中医临床研究所、中药研究所、声测经络研究所、医史文献研究所、辽宁省中药新药研制开发中心）、三馆（图书馆、医史教育博物馆、中药标本馆）；二厂（制药厂、印刷厂）、三所附属医院、二十二所教学医院、二所实习医院、一所附属卫生学校、一个国际培训中心、二所国外分校（辽宁中医学院日本分校、辽宁中医学院附属日本中医药学院）。

　　学校是国家教育部确定招收华侨、港澳台学生的院校及第一批有条件接受外国留学生的高等院校之一。是国家药品监督管理局指定的国家药品临床研究基地、国家中医药管理局确定的全国中医药人员外语培训四大中心之一，是全国中医药文献检索分中心、全国小儿肺炎研究中心、全国中医急症医疗中心、国家十五重大科技专项“创新药物与中药现代化”“新药临床试验关键技术与平台”建设单位。

　　学校师资力量雄厚，现有教授、主任医师、主任药师146名，副教授、副主任医师和其他护、技师等副高职以上人员370名，讲师、主治（药、护、技）师703名。学院现有64个教研室，151个学科，32个教学实验室。图书馆现有藏书45万册。

　　近年来，为了适应高等教育改革的需要，学校的教学、科研、医疗等不断发展，装备了电子显微镜、高压气相、高压液相、PCR扩增仪、多功能显微镜等先进教学设备。综合性附属医院有病床1，800余张，科室齐全，特色突出。